Lorsque les traitements médicamenteux ont échoué, la chirurgie peut être utilisée : les interventions les plus courantes sont la prostatectomie ouverte (adénomectomie) et la résection transurétrale, une opération mini-invasive consistant à pratiquer la résection de la prostate par l’urètre. D’autres techniques font l’objet de recherches, comme la vaporisation transurétrale de la prostate, la thermothérapie transurétrale par micro-ondes et la résection ou énucléation laser. Certaines d’entre elles se font d’ailleurs leur place dans la pratique urologique.